你提到已经走了合作医疗，但这并不影响你申请工伤认定。《工伤保险条例》第十四条明确规定了工伤认定的条件，只要符合这些条件，你仍有权申请工伤认定。虽然已使用合作医疗，但工伤赔偿与合作医疗并不冲突，你可以依法向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请，以保障自己的合法权益。
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从法律角度，你应首先确保自己的安全，并尽快收集相关证据，如医疗记录、事故现场照片等。然后，依据《工伤保险条例》第十四条，向劳动保障行政部门提出工伤认定申请。若老板不配合，可寻求工会或法律援助机构的帮助，必要时通过劳动仲裁或诉讼途径维护自己的合法权益。
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若老板仍不配合工伤认定，你可采取以下措施：1. 直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请，由行政部门进行调查；2. 收集医疗证明、事故现场照片等证据，以支持你的工伤申请；3. 若行政部门认定工伤，老板仍不赔偿，可申请劳动仲裁或提起诉讼。