店铺经营权转让合同纠纷需依法处理。依据《民事诉讼法》，合同纠纷可通过多种途径解决，不及时处理可能导致权益受损、经济损失等不良后果。
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处理店铺转让纠纷：1. 协商：双方友好沟通，达成和解协议。2. 调解：请第三方调解机构介入，寻求共识。3. 仲裁：依据仲裁协议，提交仲裁机构裁决。4. 诉讼：若协商、调解、仲裁无果，可向法院提起诉讼，依据《民事诉讼法》维护权益。
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处理店铺转让合同纠纷，常见方式有协商、调解、仲裁、诉讼。根据纠纷性质和双方意愿，选择合适方式以高效解决纠纷。